ゲノム解析受託サービス
大学・公的研究機関向けに、高品質なオミクス解析を低コストで提供するゲノム解析企業です。mRNA-Seq・miRNA-Seq・ChIP-Seq・WGS・WES・16S など幅広い受託解析に対応しています。
次世代シーケンサー（NGS）は、1回のランで数千万〜数十億bpの塩基配列情報を取得できる高性能・ハイスループット技術です。従来のサンガー法と比べ圧倒的なコストパフォーマンスを誇り、遺伝子発現解析・変異解析・エピゲノム解析・微生物叢解析など、現代のライフサイエンス研究に不可欠なプラットフォームとして広く活用されています。
GeneMotionsでは、DNBSEQおよびIlluminaプラットフォームを用いたNGS受託解析を提供しています。サンプルの受領からシーケンシング、バイオインフォマティクス解析、データ納品まで一貫して対応し、研究者の皆様の研究推進をサポートします。
解析の流れ
サンプルを受領後、Agilent BioAnalyzer等を用いた品質確認（サンプルQC）を実施。品質基準を満たしたサンプルのみ次工程へ進めます。
研究目的に応じた適切な手法でライブラリを作製。ライブラリQCにより品質と定量性を確認した後、シーケンシングへ進みます。
DNBSEQ・Illuminaプラットフォームを用いてシーケンシングを実施。データQCにより品質を確認し、Q30 ≥ 80%以上のデータのみ納品します。
fastqデータに加え、差次的発現解析・GO/KEGG解析・ボルカノプロット等の標準解析レポートを納品。追加解析オプションも対応可能です。
Mission
多くの大学・公的研究機関では政府の緊縮財政により研究資金の不足が顕著です。物価高騰で機器・試薬コストも増加しています。GeneMotionsは、そのような状況に直面する研究者の皆様が安心して研究を継続できるよう、高品質な解析サービスをコストパフォーマンス高くご提供します。
対応プラットフォーム
各サービス名をクリックすると、詳細な解析内容・サンプル要件・データ解析項目をご確認いただけます。
細胞内の全mRNAを網羅的に解析し、遺伝子発現プロファイルを取得します。DNBSEQプラットフォームによる広いダイナミックレンジと高い再現性を特徴とし、スプライスバリアント・融合遺伝子の検出も可能。既知のゲノム配列を持たない生物種にも対応します。
mRNA-Seqは、ある時点における細胞内の全mRNA（トランスクリプトーム）を網羅的に解析する技術です。mRNAのpoly(A)テールを利用して選択的に捕捉し、cDNAへの逆転写を経てライブラリを作製します。ストランド特異的シーケンシング（strand-specific sequencing）に対応しており、センス鎖・アンチセンス鎖を区別した精度の高い発現解析が可能です。データ量は標準3 Gbまたは6 Gbから選択できます。
| 種類 | 推奨濃度 / 量 |
|---|---|
| Total RNA（動物） | ≥65 ng/μl, ≥400 ng RIN≥6.5, 28s/18s≥1 |
| Total RNA（昆虫） | ≥20 ng/μl, ≥1 μg |
| Total RNA（植物） | ≥20 ng/μl, ≥1 μg RIN≥6.5, 28s/18s≥1 |
| オリゴDNA濃縮mRNA | ≥6 ng/μl, ≥30 ng Main band >1 kb |
※ DNAなし・タンパク質コンタミなし・過剰な5sなし・無色透明でべたつかないこと
UMI（分子識別子）技術により、PCRによる重複リードを排除した高精度なmicroRNA発現解析です。1塩基の解像度で既知miRNAの同定と新規miRNAの予測が可能。miRBaseデータベースを用いたアノテーションまで対応します。
miRNA（microRNA）は20〜24塩基長の1本鎖RNA分子で、真核生物における遺伝子の転写後発現調節に関与します。miRNAの3'末端・5'末端の特殊な構造とPAGEを利用してライブラリを作成し、illuminaプラットフォームでシーケンスします。UMI（分子識別子）技術により、単一RNA分子由来のPCR重複を排除できます。
| 種類 | 推奨濃度 / 量 |
|---|---|
| Total RNA（動物） | ≥65 ng/μl, ≥400 ng RIN≥6.5, 28s/18s≥1 |
| Total RNA（昆虫） | ≥150 ng/μl, ≥1 μg |
| Total RNA（植物） | ≥180 ng/μl, ≥1 μg 28s/18s≥1 |
| Total RNA（原核生物） | ≥180 ng/μl, ≥3 μg 23s/16s≥1 |
※ DNA・タンパク質コンタミなし・過剰な5sなし・無色透明でべたつかないこと
クロマチン免疫沈降法（ChIP）で精製したDNAをシーケンスし、転写因子・ヒストン修飾などのDNA結合タンパクがゲノム上のどの領域に結合しているかを網羅的に解析します。お客様がChIPで準備されたDNAをご送付ください。
ChIP-Seqは、クロマチン免疫沈降法とNGSを組み合わせ、ゲノム全域にわたるタンパク質-DNA相互作用を解析する技術です。転写因子、ヒストン修飾、その他のDNA結合タンパクの結合部位を網羅的に同定できます。ユーザー様がChIPで準備したDNAライブラリをご送付いただきます。
| 項目 | 要件 |
|---|---|
| サンプル形態 | ChIP済みDNA（ライブラリ未作製） |
| 推奨量 | 要相談（ChIPの収率による） |
| 品質 | タンパク質コンタミなし |
| コントロール | Input DNAのご用意を推奨 |
※ ChIPの実験条件・サンプル量については事前にご相談ください
生物の全ゲノムDNA配列を網羅的に解析するハイスループットシーケンシングです。SNP・InDel・CNV・SV（構造変異）など、あらゆる種類の遺伝的変異を包括的に検出。基礎研究・疾患研究・進化生物学・個別化医療に幅広く活用されています。FFPE・cfDNA・ctDNAにも対応可能です。
WGSは、生物の全ゲノムDNA配列を網羅的に解析するハイスループットシーケンシング技術です。NovaSeq 6000・NovaSeq X Plus・DNBSEQ-T20を活用し、SNP・InDel・CNV・構造変異など、ゲノム内のあらゆる遺伝的変異を包括的・正確に検出します。FFPE、cfDNA、ctDNAなど複数サンプルタイプに対応し、PCRフリーライブラリ作製も選択可能です。
| サンプル種類 | 推奨濃度 / 量 |
|---|---|
| gDNA | ≥12.5 ng/μl, ≥1 μg Main band >10 kb, タンパク質・RNAコンタミなし |
| FFPE DNA | ≥10 ng/μl, ≥500 ng 1000 bp以上のバンド >50% |
キャプチャー法でエクソームDNAを濃縮してシーケンスする、WGSに代わる費用対効果の高い手法です。疾患関連変異の特定・標的治療のサポート・希少疾患研究に最適。Agilent・IDT・Rocheなど複数ブランドのキャプチャープローブに対応しています。
WESは、シーケンスキャプチャー法でエクソームDNAを濃縮し、全ゲノムシーケンシングに代わる費用対効果の高い解析を提供します。Illumina NovaSeq 6000・NovaSeq X Plusを使用し、高深度・高精度のデータを取得。疾患関連変異の特定・標的治療研究・希少疾患の遺伝子解析に最適です。
| 項目 | 要件 |
|---|---|
| サンプル種類 | ゲノムDNA |
| 推奨濃度 | ≥12.5 ng/μl |
| 推奨量 | ≥1 μg |
| 最低量 | ≥100 ng |
| 品質 | タンパク質・RNAコンタミなし |
16S（細菌・古細菌）・18S（真核微生物）・ITS（真菌）の超可変領域をターゲットとしたアンプリコンシーケンスにより、環境サンプル中の微生物種組成・多様性・群集構造を解析します。腸内細菌叢・土壌・海洋・食品など幅広いサンプルに対応しています。
16S（細菌・古細菌）、18S（真核微生物）、ITS（真菌）それぞれの超可変領域をターゲットとしたアンプリコンシーケンシングです。個々の微生物を培養・分離することなく、環境サンプル中の微生物の多様性と群集構造を分子生物学的に解析できます。NovaSeq 6000・NextSeqなど複数プラットフォームに対応しています。
| 項目 | 要件 |
|---|---|
| サンプル種類 | ゲノムDNA（16S用） |
| 推奨濃度 | ≥12.5 ng/μl |
| 推奨量 | ≥1 μg |
| 最低量 | ≥200 ng |
| バンド | Main band >10 kb |
※ タンパク質・RNAコンタミなし・粘着性のあるシルクを含まない・無色透明なサンプル
上記の標準サービス以外にも、ショットガンメタゲノム解析（≥6 Gb〜、PE150）・微生物全ゲノムシーケンス（細菌≥100X / 真菌≥50X）・全ゲノムバイサルファイトシーケンス（WGBS）・LncRNA-Seq・circRNA-Seqなど、多様なオミクス解析に対応可能です。解析用PC・周辺機器の販売も承っています。まずはお気軽にご相談ください。
| サービス | リード長 | 推奨データ量 | 品質基準 | 標準納期 |
|---|---|---|---|---|
| mRNA-Seq | PE150 | 3 / 6 Gb | Q30 ≥ 80% | QC後 25営業日 |
| miRNA-Seq | PE150 | 3 Gb (10M reads) | Q30 ≥ 85% | QC後 35営業日 |
| ChIP-Seq | SE50 | 2,000万 reads | Q30 ≥ 80% | QC後 35〜42営業日 |
| WGS | PE150 | 90 Gb / sample | Q30 ≥ 85% | QC後 25営業日〜 |
| WES | PE150 | 100X (10 Gb) / 200X (20 Gb) | Q30 ≥ 85% | QC後 28〜35営業日 |
| 16S / 18S / ITS | PE250 | ≥ 30,000 reads / sample | Q30 ≥ 80% | QC後 55営業日 |
| メタゲノム | PE150 | ≥ 6〜10 Gb | Q30 ≥ 85% | 要相談 |
| 微生物全ゲノム | PE150 | 細菌≥100X / 真菌≥50X | Q30 ≥ 85% | 要相談 |
指定代理店またはメールにてサービス内容・サンプル数をご連絡ください。担当者よりお見積りをご案内します。
チューブにIDを明記しパラフィルムで密封の上、代理店担当者へ直接お渡しください。FedEx輸送手配・ドライアイス準備・ラベル印刷は代理店が行います。
受領後、サンプルQC（約1週間）を実施。QC合格後にライブラリ作成・シーケンシングを行います。QC不合格の場合はご連絡します。
シーケンシング後、データ解析を実施しFastqファイルおよび標準解析レポートを納品。追加解析オプションも後から申し込み可能です。
サンプルQC・ライブラリQC・データQCの3段階で品質を徹底管理。Q30 ≥ 80%以上のデータのみを納品し、論文掲載可能な高品質・高再現性のデータを保証します。
fastq納品にとどまらず、差次的発現解析・GO解析・KEGGパスウェイ・クラスタリング解析など論文に直結する解析結果を標準提供。バイオインフォマティクスの負担を大幅に軽減します。
動物・植物・昆虫・原核生物・微生物まで幅広く対応。微量・特殊サンプルも柔軟にご相談に応じます。研究目的に合わせた最適な解析プランをご提案します。
国内外のシーケンスサプライヤーと直接提携し、少人数運営で経費を徹底削減。科研費・研究費が限られた大学・公的研究機関でも利用しやすい価格を実現しています。
製薬企業・大学・公的研究機関で発生する大規模オミクスデータ解析を安価で提供するために設立されたBtoB企業です。国内外のシーケンスサプライヤーと提携し、少人数運営によるコスト最適化を実現しています。代理店様を通じた受注・サービス提供となります。
サービス種類・サンプル数・解析オプションにより異なります。指定代理店経由でお見積りをご提示しますので、まずはお問い合わせください。
サンプルは代理店担当者へ直接お渡しください。国際輸送（FedEx）の手配はGeneMotionsが行います。代理店様がドライアイス充填・FedExラベルの印刷・貼付・発送手続きを担当します。サンプルには1.5 mLまたは2.0 mLチューブを使用し、サンプルシート記載のIDをキャップに明記してパラフィルムで密封してください。
QC合格後に解析を開始しますので、不合格の場合は速やかにご連絡します。再送が必要な場合はご相談ください。
はい、可能です。サンプルのシーケンス受託後でも、追加で解析サービスをお申し込みいただけます。
動物・昆虫・植物・原核生物など幅広い生物種に対応しています。種類によってサンプル要件が異なりますので、詳細は各サービスの「詳細を見る」からご確認ください。
はい、本サービスは研究目的のみにご利用いただけます。診断・臨床目的への利用はお断りしております。
サービス内容・サンプル数・生物種をご連絡いただければ、迅速にお見積もりをご提示します。まずはお気軽にご相談ください。
※ 本サービスは研究目的以外に利用できません。
※ 代理店様を介した受注・サービス提供となります。